根治性肾切除术后，约20%的患者会出现术后并发症，死亡率约2%。全身性并发症可发生于任何手术后，充分的术前准备、避免术中低血压、适当补充液体、术后呼吸训练等可以减少并发症的发生。

根治性左肾切除可能导致胰腺尾部损伤，最好的处理方式是行胰腺部分切除术。术中未能发现的胰腺损伤甚至可能导致术后胰瘘。

保留肾单位手术术中可能出现出血，根治术后也可能发生。手术其他并发症还包括瘘道形成、肾功能不全等。

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